PyMOL - Download

las cosas buenas

Hombre, el modo dibujos animados es salvaje. Cargas un archivo PDB, digamos, una proteína de pico de coronavirus, y de repente esas cadenas desordenadas se convierten en hélices y láminas suaves. Es como ver una proteína plegarse en tiempo real. ¿Y el truco de la transparencia? Se puede hacer que la superficie de una proteína sea semitransparente para poder ver una molécula de fármaco escondida dentro de un bolsillo de unión. Eso es oro para presentaciones o artículos. Lo usé para mostrarle a una profesora cómo una mutación interrumpe una interacción clave; dijo que era la visualización más clara que había visto en todo el semestre. Además, la capacidad de crear scripts en Python es una joya escondida. Escribí un script rápido para colorear automáticamente los residuos mediante carga y listo. No hacer clic en los menús durante 20 minutos.

Lo no tan bueno

Sí, es gratis, lo cual es sorprendente, pero la interfaz no ha envejecido bien. Parece algo de 2008: muchos menús, comandos crípticos y cero información sobre herramientas. Si aún no estás familiarizado con el modelado molecular, la primera hora es pura frustración. La documentación también es escasa. Y aunque maneja toneladas de tipos de archivos, abrir algunos mapas volumétricos puede bloquearlo si su sistema no es robusto. Además, no hay tutorial incorporado. Básicamente te arrojan al fondo. Entonces, si solo está buscando un visor rápido de modelos 3D, es posible que este no sea para usted. Es para personas que necesitan precisión, no comodidad.

En pocas palabras

Si estás en bioquímica, biología estructural o simplemente estás tratando de comprender la estructura de las proteínas para una clase, PyMOL - Descargar para Mac vale cada segundo de configuración. No es bonito, no es fácil, pero es preciso. Y es gratis. Entonces, a menos que esté haciendo una tarea básica, omita las aplicaciones de clickbait y vaya directamente a esto. Es el verdadero negocio.